2009年7月26日 (農歷六月初五)，馬英九當選中國國民黨主席。
中國國民黨2009年7月26日舉行黨主席和黨代表選舉，馬英九當選黨主席，獲得285354票，得票率為93.87%。
另據國民黨中央公布的投開票結果，此次國民黨主席選舉的投票率為56.95%。
馬英九在當選后召開記者會表示，去年5月以來，兩岸開啟了和平共榮的契機，在“九二共識”基礎上恢復了中斷10年的兩會協商，簽署了9個協議和1個共識，臺海出現了和平的曙光。
馬英九表示，在今年9月國民黨第十八次代表大會上，將建議把國共兩黨達成的“兩岸和平發展共同愿景”繼續列入國民黨的政綱。他說：“這是重要的歷史承諾，我們不會忘記，一定會執行。”
他還表示，國共之間的交流、溝通平臺發揮了非常大的作用，國民黨將繼續維持這一平臺。同時，希望國共兩黨共同主辦的兩岸經貿文化論壇持續辦下去。
點評：中國國民黨的這次選舉還是為馬英九集中管理加大管理力度做的一種準備