1640年12月1日，葡萄牙脫離哈布斯堡王朝統治，恢復獨立。西班牙哈布斯堡王朝
西班牙歷史上的哈布斯堡王朝，是指1556年至1700年間統治西班牙，西屬尼德蘭和意大利部分公國和1580年至1640年間統治葡萄牙的家族。西班牙哈布斯堡王朝與奧地利哈布斯堡王朝同宗，而其母系祖先分別為卡斯蒂利亞女王伊莎貝拉一世和阿拉貢國王斐迪南二世，他們都是特拉斯塔馬拉家族的成員。而在1700年后繼承西班牙王位的都是波旁家族的成員。
葡萄牙插曲
在西班牙統一后，哈布斯堡王室漸漸向葡萄牙滲透。通過互相通婚，使哈布斯堡的血統混入葡萄牙的阿維士王室。菲利普二世繼西班牙王位后，葡萄牙出現王位繼承危機。1578年，菲利普二世的表弟，葡萄牙王塞巴斯蒂昂一世發動對摩洛哥的征戰，但不幸戰敗后在撤退中橫渡馬哈贊河時溺死(葡國民的說法是失蹤)。他的叔爺爺沒有子嗣的紅衣主教恩里克還俗繼承王位，稱為純潔的恩里克一世，最后于1580年謝世，由另一位侄子安東尼奧暫繼王位。但安東尼奧的繼承并不獲教皇承認，教皇格列高利十三世反而傾向由恩里克的外甥，西班牙王菲利浦承繼葡萄牙王位。
同年11月，菲利浦派阿爾瓦公爵帶領軍隊開進葡萄牙，很快攻陷里斯本，安東尼奧被迫流亡巴黎和葡萄牙若干個外島。葡萄牙疏密院迫于軍事和教宗的壓力，容許菲利普有條件地繼承葡萄牙王位，成為葡萄牙王菲利普一世。而條件便是：葡萄牙維持由一獨立政府管治，不受西班牙政府管轄 。葡萄牙王國及其海外領地不得被國王擅自收編為西班牙領土或行省 。維持葡萄牙語的國語地位。在西班牙吞并葡萄牙的同時繼承了葡萄牙的海外殖民地，使西班牙成為當時世界上最強大的國家。
但是哈布斯堡王朝在葡萄牙的名聲一向不好，而且無敵艦隊和三十年戰爭的戰敗，更令西班牙哈布斯堡王室瀕臨破產邊緣，如菲利浦二世在去世前兩年的1596年宣布破產。1609年尼德蘭也發生革命從西班牙獨立出去。在三十年戰爭期間歐洲一片反哈布斯堡的浪潮中，葡萄牙終于在1640年發動恢復獨立活動。同年12月1日，葡萄牙疏密院立先王曼努埃爾兒一世的玄孫，布拉干薩公爵約翰為葡萄牙王若昂四世。葡萄牙恢復獨立，哈布斯堡王室也結束了對葡萄牙達60年，歷3代君主的管治。